Biorepositories National Institutes of Health
Trypanogen About Human African Trypanosomiasis Objectives of TrypanoGEN Founder of TrypanoGEN
The Wellcome Trust
African Society of Human Genetics
Employment and Post-Graduate Opportunities
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H3 Africa
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Research Partners

Objectifs de TrypanoGEN

L'objectif global de TrypanoGEN est d'améliorer la santé des personnes vivant dans certains des pays les plus pauvres dans le monde qui portent un fardeau disproportionné de maladies infectieuses. Malgré leur importance, l'étude de nombreuses maladies tropicales a été inférieure à celle des maladies des pays développés. Le réseau est TrypanoGEN rétablir l'équilibre en effectuant une recherche de haute qualité dans la trypanosomiase humaine africaine. Les données générées par ce réseau s'étendra au-delà de la sensibilité de la trypanosomiase en fournissant une ressource unique pour étudier la variation génétique humaine à travers l'Afrique. Les principaux objectifs du projet sont les suivants:

Générer une base de données des variations génétiques humaines dans différents pays africains

Ce sera à la disposition de la communauté scientifique pour la recherche sur d'autres maladies et l'analyse de la diversité génétique humaine et son évolution. Cela permettra aux chercheurs d'identifier des marqueurs génétiques informatifs dans la population humaine. l'amélioration de la précision des stratégies utilisées dans les études d'association pangénomique (GWAS), fournissant de nouveaux panneaux de référence du génome africains. Au cours de ce projet, cette base de données sera interrogée afin de procéder à un GWAS dans la susceptibilité génétique humaine à tyrpanosomiasis et d'identifier les gènes et les voies importantes à la fois dans le contrôle de la maladie et la résistance à l'infection.

  La variation humaine
Tubes échantillons  

Créez un vaste biobanque logé dans concentrateurs de réseau

Un objectif majeur du TrypanoGEN est de créer un vaste biobanque de deux échantillons rétrospectifs et prospectifs avec des données parasitologiques et cliniques normalisées. Pour faciliter la recherche typanosome, la collection comprendra des contrôles endémiques et disposent phénotypes sensibles et résistantes. Ces collections seront à la base de la biobanque du réseau et sera étendu à d'autres échantillons de petites biobanques existantes dans le réseau des instituts rayons. L'échantillonnage a été entrepris en trois étapes:
(1) Les échantillons archivés: exisiting collections d'échantillons précédemment archivés sont en cours de centralisation dans les concentrateurs de réseau. Des échantillons ont été évalués et la qualité des données cliniques associées / parasitologique recueillies.
(2) échantillonnage rétrospective: En Tb gambiense les zones d'endémie, les groupes de réseau sont revisite et d'échantillonnage de patients déjà diagnostiqués et traités et les individus asymptomatiques non confirmées (séropositifs).
(3) l'échantillonnage prospective: Nouveaux patients atteints de THA et les personnes séropositives seront identifiés dans le cadre des enquêtes de surveillance active mis en œuvre par les équipes de rayons en collaboration avec les programmes nationaux de lutte.

Développer les infrastructures dans les laboratoires africains

Bien que les trois hubs déjà abritent des banques de tissus biologiques existants, il ya des limites à ces installations en termes de capacités, l'accès, le stockage et la sécurité. Dans le cadre du projet, l'infrastructure de recherche dans les moyeux est renforcée afin de faciliter la collecte efficace, le traitement et le stockage des échantillons avec des installations existantes posées aux normes internationales. Puisque les échantillons sont originaires de différentes régions géographiques et sont recueillies par des équipes différentes, les procédures de diagnostic et des critères communs d'inclusion sont partagées à travers les rayons du réseau. Les modes opératoires normalisés pour l'échantillonnage, le diagnostic et la collecte de données cliniques ont été conçus et sont disponibles en anglais et en français.

  Clinique en Zambie
Entraînement  

Assurer la formation des chercheurs africains

Formation et mobilité des étudiants diplômés, boursiers postdoctoraux et de scientifiques du personnel sont des éléments clés pour le renforcement de la recherche à long terme dans HAT. Le projet de TrypanoGEN diffuse expertise à travers l'Afrique et l'Europe et le renforcement du potentiel de recherche des partenaires du réseau sont associés dans les pays endémiques. Le programme de formation est structuré par une philosophie »de formation des formateurs». Un certain nombre de possibilités de loisirs de formation en génomique de pointe sont prévus qui permettra d'améliorer la capacité de recherche locale. Plus précisément, TrypanoGEN offre:

• Ateliers de prélèvement d'échantillons et des biobanques
• Ateliers d'analyse du génome
• Confiance cours Wellcome génome des études d'association
• Atelier sur la bioéthique
• Formation en cours d'emploi par hub-embedded bioinformaticien
• Formation à la demande par des collaborateurs externes
• des conférences / réunions scientifiques

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